MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Brachyspira pilosicoli WesB complete genome

Total Repeats: 91440

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018604	T	7	7	20	26	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018604	TAA	2	6	68	73	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018604	TAA	2	6	79	84	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018604	TAA	2	6	90	95	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018604	CTAA	2	8	107	114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018604	T	6	6	128	133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018604	ATTTT	2	10	138	147	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018604	TTAA	2	8	166	173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018604	T	8	8	217	224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018604	TCT	2	6	229	234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_018604	TAA	3	9	267	275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018604	AT	3	6	299	304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018604	TAA	2	6	364	369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018604	ATG	2	6	386	391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018604	GTT	2	6	399	404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018604	TAAA	2	8	422	429	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018604	TAT	2	6	430	435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018604	TTA	2	6	443	448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018604	TATAA	2	10	454	463	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018604	T	6	6	482	487	0 %	100 %	0 %	0 %	434380779
21	NC_018604	T	6	6	503	508	0 %	100 %	0 %	0 %	434380779
22	NC_018604	TAA	2	6	524	529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
23	NC_018604	TAA	2	6	554	559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
24	NC_018604	AAAAT	2	10	561	570	80 %	20 %	0 %	0 %	434380779
25	NC_018604	TA	3	6	587	592	50 %	50 %	0 %	0 %	434380779
26	NC_018604	ATA	2	6	652	657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
27	NC_018604	TAT	2	6	677	682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380779
28	NC_018604	TAAA	2	8	760	767	75 %	25 %	0 %	0 %	434380779
29	NC_018604	TAA	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
30	NC_018604	TTTA	2	8	821	828	25 %	75 %	0 %	0 %	434380779
31	NC_018604	AAAAT	2	10	843	852	80 %	20 %	0 %	0 %	434380779
32	NC_018604	TAG	2	6	886	891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380779
33	NC_018604	ATAAAA	2	12	892	903	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	434380779
34	NC_018604	TTTA	2	8	933	940	25 %	75 %	0 %	0 %	434380779
35	NC_018604	TAA	2	6	946	951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
36	NC_018604	GA	3	6	1002	1007	50 %	0 %	50 %	0 %	434380779
37	NC_018604	T	6	6	1014	1019	0 %	100 %	0 %	0 %	434380779
38	NC_018604	TTA	2	6	1035	1040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380779
39	NC_018604	TAA	2	6	1085	1090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
40	NC_018604	TAA	2	6	1132	1137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
41	NC_018604	TAA	2	6	1157	1162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380779
42	NC_018604	TTA	2	6	1181	1186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380779
43	NC_018604	TAT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380779
44	NC_018604	AATA	2	8	1244	1251	75 %	25 %	0 %	0 %	434380779
45	NC_018604	AGT	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380779
46	NC_018604	ATT	2	6	1295	1300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380780
47	NC_018604	TTA	2	6	1318	1323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380780
48	NC_018604	TATAT	2	10	1364	1373	40 %	60 %	0 %	0 %	434380780
49	NC_018604	AG	3	6	1377	1382	50 %	0 %	50 %	0 %	434380780
50	NC_018604	TAT	2	6	1399	1404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380780
51	NC_018604	ATA	2	6	1405	1410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
52	NC_018604	TTTA	2	8	1413	1420	25 %	75 %	0 %	0 %	434380780
53	NC_018604	TAA	2	6	1457	1462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
54	NC_018604	CTT	2	6	1478	1483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380780
55	NC_018604	TAA	2	6	1491	1496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
56	NC_018604	TA	3	6	1571	1576	50 %	50 %	0 %	0 %	434380780
57	NC_018604	AAAAT	2	10	1585	1594	80 %	20 %	0 %	0 %	434380780
58	NC_018604	TATTT	2	10	1634	1643	20 %	80 %	0 %	0 %	434380780
59	NC_018604	AT	6	12	1679	1690	50 %	50 %	0 %	0 %	434380780
60	NC_018604	TA	3	6	1708	1713	50 %	50 %	0 %	0 %	434380780
61	NC_018604	TATTT	2	10	1718	1727	20 %	80 %	0 %	0 %	434380780
62	NC_018604	TAG	3	9	1730	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380780
63	NC_018604	AGA	2	6	1761	1766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380780
64	NC_018604	TAA	2	6	1802	1807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
65	NC_018604	AATT	2	8	1838	1845	50 %	50 %	0 %	0 %	434380780
66	NC_018604	TGG	2	6	1909	1914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434380780
67	NC_018604	TGT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380780
68	NC_018604	TAA	3	9	1968	1976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
69	NC_018604	ATA	3	9	2018	2026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
70	NC_018604	AGA	2	6	2034	2039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380780
71	NC_018604	TTTAA	2	10	2059	2068	40 %	60 %	0 %	0 %	434380780
72	NC_018604	AG	3	6	2074	2079	50 %	0 %	50 %	0 %	434380780
73	NC_018604	TAA	2	6	2115	2120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
74	NC_018604	AT	3	6	2141	2146	50 %	50 %	0 %	0 %	434380780
75	NC_018604	TAA	2	6	2160	2165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
76	NC_018604	AT	4	8	2177	2184	50 %	50 %	0 %	0 %	434380780
77	NC_018604	A	6	6	2199	2204	100 %	0 %	0 %	0 %	434380780
78	NC_018604	TAA	2	6	2220	2225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380780
79	NC_018604	ATTA	2	8	2237	2244	50 %	50 %	0 %	0 %	434380780
80	NC_018604	A	6	6	2262	2267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018604	TAA	2	6	2293	2298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018604	TAAT	2	8	2303	2310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018604	TAT	2	6	2319	2324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380781
84	NC_018604	CTT	2	6	2377	2382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380781
85	NC_018604	T	7	7	2419	2425	0 %	100 %	0 %	0 %	434380781
86	NC_018604	TCT	2	6	2442	2447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380781
87	NC_018604	T	6	6	2483	2488	0 %	100 %	0 %	0 %	434380781
88	NC_018604	AT	3	6	2518	2523	50 %	50 %	0 %	0 %	434380781
89	NC_018604	TG	3	6	2592	2597	0 %	50 %	50 %	0 %	434380781
90	NC_018604	ATA	2	6	2636	2641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
91	NC_018604	TAT	2	6	2678	2683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380782
92	NC_018604	AAT	2	6	2685	2690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
93	NC_018604	TAT	2	6	2720	2725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380782
94	NC_018604	TAA	2	6	2726	2731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
95	NC_018604	A	7	7	2730	2736	100 %	0 %	0 %	0 %	434380782
96	NC_018604	T	6	6	2778	2783	0 %	100 %	0 %	0 %	434380782
97	NC_018604	TCT	2	6	2839	2844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380782
98	NC_018604	ATGC	2	8	2845	2852	25 %	25 %	25 %	25 %	434380782
99	NC_018604	ATA	2	6	2876	2881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
100	NC_018604	T	7	7	2890	2896	0 %	100 %	0 %	0 %	434380782
101	NC_018604	T	6	6	2923	2928	0 %	100 %	0 %	0 %	434380782
102	NC_018604	TTTG	2	8	2940	2947	0 %	75 %	25 %	0 %	434380782
103	NC_018604	ACAA	2	8	2959	2966	75 %	0 %	0 %	25 %	434380782
104	NC_018604	AGT	2	6	3000	3005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380782
105	NC_018604	AAT	2	6	3030	3035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
106	NC_018604	ATT	2	6	3042	3047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380782
107	NC_018604	ATA	2	6	3136	3141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380782
108	NC_018604	T	6	6	3142	3147	0 %	100 %	0 %	0 %	434380782
109	NC_018604	TCA	2	6	3154	3159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380782
110	NC_018604	T	7	7	3163	3169	0 %	100 %	0 %	0 %	434380782
111	NC_018604	TATGA	2	10	3182	3191	40 %	40 %	20 %	0 %	434380782
112	NC_018604	T	7	7	3200	3206	0 %	100 %	0 %	0 %	434380782
113	NC_018604	TCT	2	6	3247	3252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380782
114	NC_018604	CCA	2	6	3329	3334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434380782
115	NC_018604	AT	3	6	3336	3341	50 %	50 %	0 %	0 %	434380782
116	NC_018604	TATGTT	2	12	3354	3365	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	434380782
117	NC_018604	AT	3	6	3388	3393	50 %	50 %	0 %	0 %	434380782
118	NC_018604	TAA	2	6	3405	3410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018604	TA	3	6	3484	3489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018604	TA	4	8	3496	3503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018604	ATTA	2	8	3527	3534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018604	GAT	2	6	3617	3622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018604	ATA	2	6	3681	3686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380783
124	NC_018604	ATA	2	6	3714	3719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380783
125	NC_018604	ATA	2	6	3726	3731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380783
126	NC_018604	GAA	2	6	3788	3793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380783
127	NC_018604	AGA	3	9	3832	3840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380783
128	NC_018604	AGT	2	6	3841	3846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434380783
129	NC_018604	AGA	2	6	3853	3858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380783
130	NC_018604	AGA	2	6	3913	3918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434380783
131	NC_018604	TTA	2	6	3935	3940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380783
132	NC_018604	TCT	2	6	3968	3973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434380784
133	NC_018604	TTGT	2	8	3977	3984	0 %	75 %	25 %	0 %	434380784
134	NC_018604	GT	3	6	4021	4026	0 %	50 %	50 %	0 %	434380784
135	NC_018604	TAT	2	6	4069	4074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380784
136	NC_018604	TA	3	6	4093	4098	50 %	50 %	0 %	0 %	434380784
137	NC_018604	TCA	2	6	4142	4147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434380784
138	NC_018604	ATA	2	6	4153	4158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380784
139	NC_018604	TC	6	12	4228	4239	0 %	50 %	0 %	50 %	434380784
140	NC_018604	TAT	2	6	4242	4247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380784
141	NC_018604	ATA	2	6	4261	4266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380784
142	NC_018604	ATA	2	6	4338	4343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380784
143	NC_018604	TA	3	6	4342	4347	50 %	50 %	0 %	0 %	434380784
144	NC_018604	AT	3	6	4427	4432	50 %	50 %	0 %	0 %	434380784
145	NC_018604	TC	3	6	4440	4445	0 %	50 %	0 %	50 %	434380784
146	NC_018604	CTTCT	2	10	4453	4462	0 %	60 %	0 %	40 %	434380784
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149	NC_018604	TC	3	6	4540	4545	0 %	50 %	0 %	50 %	434380784
150	NC_018604	TA	3	6	4648	4653	50 %	50 %	0 %	0 %	434380784
151	NC_018604	T	6	6	4721	4726	0 %	100 %	0 %	0 %	434380784
152	NC_018604	TAA	2	6	4760	4765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380785
153	NC_018604	TATCAG	2	12	4774	4785	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434380785
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160	NC_018604	TATT	2	8	4954	4961	25 %	75 %	0 %	0 %	434380785
161	NC_018604	GTT	2	6	5001	5006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434380785
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165	NC_018604	GCA	2	6	5049	5054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380785
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173	NC_018604	T	7	7	5296	5302	0 %	100 %	0 %	0 %	434380785
174	NC_018604	T	6	6	5304	5309	0 %	100 %	0 %	0 %	434380785
175	NC_018604	AAT	2	6	5310	5315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380785
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180	NC_018604	ATT	2	6	5486	5491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434380785
181	NC_018604	ATA	3	9	5530	5538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434380785
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186	NC_018604	ATT	2	6	5593	5598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_018604	AT	3	6	5624	5629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_018604	AAT	2	6	5648	5653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_018604	TTTA	2	8	5675	5682	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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226	NC_018604	TA	3	6	6639	6644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
227	NC_018604	T	7	7	6648	6654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
228	NC_018604	TA	3	6	6657	6662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_018604	A	6	6	8241	8246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_018604	ATTT	2	8	8258	8265	25 %	75 %	0 %	0 %	434380788
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271	NC_018604	TTCTA	2	10	8455	8464	20 %	60 %	0 %	20 %	434380788
272	NC_018604	T	7	7	8482	8488	0 %	100 %	0 %	0 %	434380788
273	NC_018604	T	6	6	8490	8495	0 %	100 %	0 %	0 %	434380788
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277	NC_018604	AGC	2	6	8617	8622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434380788
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406	NC_018604	TA	3	6	12056	12061	50 %	50 %	0 %	0 %	434380790
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